马克思主义学院始于2002年亳州师专公共教学部政史地教研室，2010年12月独立设置思想政治理论课教研部，2018年6月更名为马克思主义学院，是直属于学校领导的教学科研二级机构，负责全校思想政治理论课教育教学与科学研究工作。

马克思主义学院现有教师34人，在读博士3人，具有硕士学位34人，教授4人，副教授6人，省级“教学名师”1人，省级“教坛新秀”1人。设置《习近平新时代中国特色社会主义思想概论》《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》《马克思主义基本原理》《中国近现代史纲要》《思想道德与法治》《形势与政策》六个教研室。

学院现有省级优秀教学团队1个，省级名师工作室1个，省级课程思政示范中心1个，省级大中小学思政课一体化教学改革创新联合体1个，《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》是教育部“拓金计划”示范课程，《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》《思想道德与法治》和《中国近现代史纲要》3门省级精品课程。学院获安徽省教学成果奖一等奖2项，二等奖1项，发表教科研论文40多篇。